Un altre símptoma que poden causar les malalties de l’aparell urinari, com les de molts altres òrgans, és el dolor ocasionat per la irritació de les terminacions nervioses sensitives que hi ha en algunes estructures urinàries. De manera característica, el dolor ocasionat pels trastorns dels òrgans interns, com els que constitueixen l’aparell urinari, es pot manifestar de dues maneres: com a dolor local o com a dolor referit. El dolor local és la sensació dolorosa que el pacient sent just a la zona del cos on es localitza l’òrgan afectat. En canvi, el dolor referit és el que se sent en una zona de la superfície del cos més o menys allunyada del punt exacte on se situa el trastorn. Aquesta localització del dolor referit és deguda al fet que les fibres sensitives de l’òrgan afectat i les de la zona de la pell on es refereix el dolor coincideixen en la mateixa arrel nerviosa de la medul·la espinal, i el cervell no discrimina l’origen exacte dels impulsos dolorosos.