L’examen de matèries fecals consisteix en la recollida d’una mostra de les deposicions evacuades, en general al llarg d’alguns dies, que posteriorment és observada directament, sotmesa a diverses reaccions químiques i analitzada microscòpicament.

En l’actualitat, l’examen de matèries fecals se sol·licita bàsicament per detectar una esteatorrea o presència d’elevades quantitats de greix, sang, paràsits i quantitats importants de cèl·lules immunitàries, o, també, per a realitzar amb aquesta mostra un coprocultiu.